14年前，初号机疑似神化第一形态的觉醒带来近三冲击，使世界发生前所未有的巨变。在此之后，葛城美里（三石琴乃 声音表演）等NERV旧部出走，成立了反抗seele和NERV的Wille。Wille授命明日香（宫村优子 声音表演）和真里（坂本真绫 声音表演）夺回被封印在卫星轨道上的初号机和碇真嗣（绪方惠美 声音表演），但绝对禁止真嗣登上初号机。感受到周遭的敌意，懵懂的真嗣跟随绫波丽（林原惠美 声音表演）登上突然入侵的九号机，返回了千疮百孔的NERV总部。在这里，他意外重逢朝思夜想的绫波，还从父亲那里得知自己将和美少年渚薰（石田彰 声音表演）共同驾驶十三号机。长达14年的空白，期间的沧桑巨变和情感纠葛让真嗣不知所措。而看似温柔的渚薰为他揭开了种种难以置信的真相…… 本片为EVA新剧场版四部曲的第三部作品中的情感描写让人心潮澎湃。
绪方惠美 林原惠美 三石琴乃 宫村优子 山口由里子 立木文彦 石田彰 清川元梦 山寺宏一 优希比吕 长泽美树 子安武人 麦人 川村万梨阿 矢岛晶子 松本保典 长嶝高士 泽木郁也 山野井仁 永野广一 菅原淳一 涉谷茂
高山南 山崎和佳奈 神谷明 山口胜平 林原惠美 岩居由希子 高木涉 大谷育江 绪方惠美 高乃丽 爱河里花子 斋贺光希 田中秀幸 岛本须美 绪方贤一 茶风林 井上和彦 松井菜樱子 平田广明 藤本让 依田英助 堀部隆一 千叶一伸 小林清志 速水奖 速水圭 宝龟克寿 中岛聪彦 长嶝高士 细井治 增谷康纪 百百麻子 村井每早 莲池龙三 津嘉山正种 折笠爱
矢岛晶子 楢桥美纪 藤原启治 兴梠里美 真柴摩利 林玉绪 一龙斋贞友 佐藤智惠 纳谷六朗 七绪春日 富泽美智惠 三石琴乃 玉川纱己子 铃木玲子 高山南 根谷美智子 伊藤静 阪口大助 大本真基子 大友龙三郎 上田祐司 胜杏里 宫泽正 木村雅史 伊东美弥子 指原莉乃 坂本真绫 浪川大辅 堀内贤雄 平田广明